Patologi anatomi adalah cabang ilmu kedokteran yang mempelajari organ dan jaringan tubuh (kelompok sel). Ilmu ini dianggap sebagai salah satu cabang diagnostik kedokteran bersama dengan radiologi dan spesialisasi patologi lainnya, misalnya, mikrobiologi dan patologi kimia.

Patologi anatomi memiliki dua subdivisi utama. Pertama, histopatologi, yang melibatkan pemeriksaan seluruh jaringan sampel di bawah mikroskop. Histopatologi melibatkan pemeriksaan jaringan utuh dari biopsi atau operasi di bawah mikroskop. Ini sering dibantu oleh penggunaan teknik pewarnaan khusus dan tes terkait lainnya, seperti menggunakan antibodi untuk mengidentifikasi berbagai komponen jaringan.